Qu’est-ce qu’une espèce cryptique ?
Une espèce cryptique est une espèce difficile à identifier par sa morphologie. Elle est souvent découverte lors d’analyses génétiques. Chez les petits Mammifères, un tiers des espèces de métropole posent question !
Ces interrogations concernent notamment les complexes suivants :
- Arvicola amphibius / Arvicola monticola
- Microtus agrestis / Microtus lavernedii
- Microtus pyrenaicus / Microtus gerbei
- Sorex aranaeus / Sorex coronatus
- Talpa europaea / Talpa aquitania
Programme national d’étude des espèces cryptiques de petits mammifères
Afin d’améliorer la connaissance des espèces de petits Mammifères terrestres métropolitains tant concernant leur taxonomie, leur répartition que les critères de reconnaissances, la SFEPM coordonne un programme national d’étude sur ces espèces cryptiques. Ce programme est réalisé en collaboration avec l’Université Claude Bernard (Lyon 1), l’Université de Bourgogne Europe et le Muséum National d’Histoire Naturelle.
Pour améliorer ces connaissances, ce programme cherche à obtenir des informations génétiques et morphométriques sur ces espèces cryptiques. L’étude repose ainsi sur la collecte de cadavres encore frais sur lesquels des analyses génétiques et morphométriques (mesure tête + corps, mesure, queue + pinceau, mesure patte postérieure + griffe) sont réalisées. Il est important de noter qu’aucun individu n’est sacrifié pour cette étude.
Quand un cadavre est trouvé, le collecteur (associations naturalistes, ONF, bureaux d’études…) remplit une fiche et entrepose son spécimen dans un congélateur. Il l’envoie ensuite à un relai en région (cf. ci-dessous) qui transfère l’ensemble des spécimens récupérés au coordinateur national. Ce dernier tient à jour un fichier des collectes et répartit les spécimens entre les trois laboratoires de recherches partenaires pour analyse génétique. L’ensemble des informations récupérées est ensuite diffusé sur le site de l’ONM et via le SINP.
-> Pour participer à cette enquête, nous mettons à votre disposition l'étiquette à joindre dans le sachet qui contient le cadavre du micromammifère collecté dans le cadre de cette étude.
Relais en région
Vous avez ci-dessous accès aux personnes relais en région dans le cadre de cette enquête.
- Auvergne-Rhône-Alpes
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Auvergne : AZNAR Mélanie (GMA) : m.aznar@mammiferes.org
Rhône-Alpes : DARINOT Fabrice (RNN ML) : fabrice.darinot@espaces-naturels.fr - Bourgogne-Franche-Comté
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Bourgogne : MALLET Alexandre (SHNA) : alexandre.mallet01@gmail.com
Franche-Comté : BABSKI Simon-Pierre (LPO) : simon-pierre.babski@lpo.fr - Bretagne
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BOIREAU Josselin (GMB) : josselin.boireau@gmb.bzh
- Centre-Val-de-Loire
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Indre-et-Loire : DUPIN Oscar : oskardupin@gmail.com
- Corse
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CHALBOS Marion : marion.chalbos@gmail.com
- Grand-Est
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Alsace : BISCH Aurélie (GEPMA) : a.bisch@gepma.org
Lorraine : CAZAILLON Jeanne (GEML) : jeanne.cazaillon@geml.fr - Hauts-de-France
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Nord-Pas-de-Calais : POIRSON Claire (CMNF) : claire070@hotmail.fr
Aisne : BRICE Perrine (CPIE) : p.brice@cpie-aisne.comPicardie Nature : HERMANT Thomas
thomas.hermant@picardie-nature.org
- Ile-de-France
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BONHOMME Jennifer (OFB) : jennifer.bonhomme@ofb.gouv.fr
- Normandie
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LEBOULENGER François (GMN) : francois.leboulenger@orange.fr
- Nouvelle-Aquitaine
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Aquitaine : RUYS Thomas (GRIFS) : thomas.ruys@grifs.fr
Limousin : MÉTÉGNIER-BROSSE Clémence (GMHL) : c.brosse@gmhl.asso.fr
- Occitanie
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DUPUY Hélène : helene.dupuy@neuf.fr
COGard : LAFORGE Maxime
mlaforge@cogard.org - Pays de la Loire
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HEUGAS Tiphaine (LPO Vendée) : tiphaine.heugas@gmail.com
- Provence-Alpes-Côte d’Azur
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En attente de contact
Webinaire sur le programme
La Coordination Nationale Petits Mammifères a proposé un webinaire sur le programme des espèces cryptiques et son état d'avancement en février 2026.
Si vous n'avez pas pu y participer, vous avez la possibilité ici de le visionner !
Programme du webinaire :
- Présentation du programme Espèces cryptiques par Fabrice Darinot et Hélène Dupuy
- Difficulté d’identification chez les espèces proches : le cas de quelques espèces cryptiques de campagnols par Sophie Montuire
- Identification moléculaire, diversité morphologique et phylogéographie des mulots en France par Pascale Chevret
- Au-delà des apparences : l’apport des données génétiques pour identifier et cartographier les Eulipotyphles de France par Violaine Nicolas-Colin
- Circulation de Parahenipavirus chez les musaraignes de Métropole par Olivier Reynard
- Conclusion et échanges